Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RDH12Q96NR8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RDH12Q96NR8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms