Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC136Q96JN2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC136Q96JN2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms