Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms