Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C6Q969F1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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GTF3C6Q969F1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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GTF3C6Q969F1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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GTF3C6Q969F1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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GTF3C6Q969F1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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GTF3C6Q969F1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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GTF3C6Q969F1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6Q969F1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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