Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA4DQ92854 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA4DQ92854 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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