Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF397Q8NF99 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF397Q8NF99 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms