Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF548Q8NEK5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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