Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CARMIL3Q8ND23 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CARMIL3Q8ND23 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms