Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM87AQ8NBN3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms