Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC63Q8NA47 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms