Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms