Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKAP1Q86WV1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms