Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PBRM1Q86U86 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PBRM1Q86U86 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms