Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT28Q7Z3Y7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms