Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PQLC2Q6ZP29 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PQLC2Q6ZP29 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms