Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LCN8Q6JVE9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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LCN8Q6JVE9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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LCN8Q6JVE9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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LCN8Q6JVE9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LCN8Q6JVE9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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