Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GGNBP1Q5YKI7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GGNBP1Q5YKI7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.8 ms