Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CFAP70Q5T0N1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP70Q5T0N1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms