Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KHDC3LQ587J8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms