Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MEIS2-205ENST00000397624 2748 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.831e-11■■■■■ 34.1
PCBP2Q15366 MEIS2-203ENST00000340545 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.851e-11■■■■■ 34.1
PCBP2Q15366 MEIS2-201ENST00000314177 2775 ntTSL 29.55□□□□□ -0.881e-11■■■■■ 34.1
PCBP2Q15366 DGKZ-218ENST00000529698 792 ntTSL 312.59□□□□□ -0.394e-27■■■■■ 34.1
PCBP2Q15366 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 34.1
PCBP2Q15366 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 27.96□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 34.1
PCBP2Q15366 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.563e-8■■■■■ 34.1
PCBP2Q15366 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 34.1
PCBP2Q15366 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 34
PCBP2Q15366 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.313e-13■■■■■ 34
PCBP2Q15366 USB1-212ENST00000566082 3888 ntTSL 210.18□□□□□ -0.783e-13■■■■■ 34
PCBP2Q15366 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 314.27□□□□□ -0.139e-11■■■■■ 34
PCBP2Q15366 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 221.3■■□□□ 14e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 GGT7-202ENST00000427420 615 ntTSL 218.25■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 34
PCBP2Q15366 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 34
PCBP2Q15366 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 ZBTB17-210ENST00000479282 1054 ntTSL 212.99□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 34
PCBP2Q15366 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.956e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.896e-7■■■■■ 34
PCBP2Q15366 SMARCD1-206ENST00000549274 611 ntTSL 39.46□□□□□ -0.91e-10■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 CDK16-208ENST00000517426 1574 ntTSL 517.69■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 UGGT1-204ENST00000430075 586 ntTSL 414.67□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)12.56□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-209ENST00000505072 556 ntTSL 411.27□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.562e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.692e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 MCF2L-214ENST00000423251 734 ntTSL 317.9■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.363e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 513.45□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 33.9
PCBP2Q15366 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-210ENST00000481084 2343 ntTSL 216.37■□□□□ 0.213e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-219ENST00000640747 1813 ntTSL 514.66□□□□□ -0.063e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-204ENST00000414373 1638 ntTSL 513.72□□□□□ -0.213e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-202ENST00000392834 1817 ntTSL 213.69□□□□□ -0.223e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-212ENST00000525456 1020 ntTSL 513.11□□□□□ -0.313e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-209ENST00000472016 568 ntTSL 213.03□□□□□ -0.323e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-207ENST00000460183 1058 ntTSL 212.38□□□□□ -0.433e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-218ENST00000640102 1195 ntTSL 512.04□□□□□ -0.483e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-206ENST00000445653 583 ntTSL 310.43□□□□□ -0.743e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DPAGT1-205ENST00000442480 999 ntTSL 57.85□□□□□ -1.153e-23■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 PDE4D-209ENST00000502575 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.128e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 MAD1L1-211ENST00000445959 831 ntTSL 317.28■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 MAD1L1-206ENST00000429625 750 ntTSL 513.05□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 520.16■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DHX35-202ENST00000373323 2347 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DHX35-203ENST00000373325 3287 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.921e-8■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DHX35-206ENST00000484417 3318 ntTSL 28.34□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 COPB1-209ENST00000533096 547 ntTSL 412□□□□□ -0.492e-11■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 COPB1-206ENST00000529210 607 ntTSL 411.29□□□□□ -0.62e-11■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-11■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 COPB1-207ENST00000529866 729 ntTSL 29.71□□□□□ -0.862e-11■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.012e-11■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 COPB1-211ENST00000534234 1584 ntTSL 58.26□□□□□ -1.092e-11■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 COPB1-210ENST00000533533 537 ntTSL 48.18□□□□□ -1.12e-11■■■■■ 33.8
PCBP2Q15366 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.162e-11■■■■■ 33.8
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