Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.718e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 217.73■□□□□ 0.438e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.428e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.258e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.428e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.221e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 ORC6-209ENST00000575571 771 ntTSL 312.69□□□□□ -0.381e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 ORC6-204ENST00000566860 1699 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.531e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 ORC6-205ENST00000567000 1560 ntTSL 29.47□□□□□ -0.891e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-11■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-11■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.833e-11■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.893e-11■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NONO-212ENST00000474431 644 ntTSL 59.08□□□□□ -0.963e-11■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NONO-210ENST00000472185 397 ntTSL 57.54□□□□□ -1.23e-11■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 27.24□□□□□ -1.253e-11■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.272e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)7.09□□□□□ -1.272e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.272e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 GOLGA4-207ENST00000437131 6947 ntTSL 1 (best)2.27□□□□□ -2.052e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.139e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.24e-8■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.364e-8■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.424e-8■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.583e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 214.57□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 513.2□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)11.36□□□□□ -0.593e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.97□□□□□ -0.653e-6■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 SRRM1-208ENST00000470243 721 ntTSL 54.98□□□□□ -1.617e-16■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 FAM192A-209ENST00000565458 1029 ntTSL 522.93■■□□□ 1.263e-10■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 EIF3H-204ENST00000518949 843 ntTSL 310.18□□□□□ -0.783e-10■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 FAM192A-203ENST00000562324 597 ntTSL 29.54□□□□□ -0.883e-10■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 EIF3H-210ENST00000522453 518 ntTSL 38.76□□□□□ -1.013e-10■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 EIF3H-206ENST00000519046 488 ntTSL 38.41□□□□□ -1.063e-10■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 EIF3H-202ENST00000517974 594 ntTSL 25.82□□□□□ -1.483e-10■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.055e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 510.93□□□□□ -0.662e-15■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 AAMP-208ENST00000475678 2270 ntTSL 215.78■□□□□ 0.121e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 AAMP-209ENST00000489767 1833 ntTSL 515.41■□□□□ 0.061e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 AAMP-205ENST00000447885 671 ntTSL 514.87□□□□□ -0.031e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.061e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.191e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 AAMP-206ENST00000461911 567 ntTSL 212.59□□□□□ -0.391e-7■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.062e-6■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.032e-6■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 SMARCA4-206ENST00000538456 738 ntTSL 315.57■□□□□ 0.082e-26■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PAXBP1-206ENST00000464256 1692 ntTSL 1 (best)25.01■■□□□ 1.598e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PAXBP1-208ENST00000472588 1410 ntTSL 1 (best)21.22■□□□□ 0.998e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.98e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.498e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.028e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.128e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PSMD2-208ENST00000459910 676 ntTSL 523.44■■□□□ 1.342e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PSMD2-204ENST00000433010 942 ntTSL 322.39■■□□□ 1.172e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PSMD2-202ENST00000417952 721 ntTSL 320.73■□□□□ 0.912e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PSMD2-213ENST00000476461 816 ntTSL 319.49■□□□□ 0.712e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PSMD2-215ENST00000487475 910 ntTSL 218.37■□□□□ 0.532e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PSMD2-219ENST00000492191 581 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CSDE1-217ENST00000534699 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.657e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.167e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.317e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.327e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.357e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.47e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.417e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.577e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 517.29■□□□□ 0.367e-8■■□□□ 11.4
PUM1Q14671 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 515.75■□□□□ 0.117e-8■■□□□ 11.4
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