Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms