Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PSME1Q06323 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSME1Q06323 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms