Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPARDQ03181 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms