Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBP5P82980 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBP5P82980 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBP5P82980 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBP5P82980 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RBP5P82980 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RBP5P82980 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RBP5P82980 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RBP5P82980 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBP5P82980 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBP5P82980 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBP5P82980 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms