Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms