Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP2S1P53680 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms