Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPFP49454 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPFP49454 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPFP49454 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPFP49454 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPFP49454 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPFP49454 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPFP49454 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPFP49454 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPFP49454 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPFP49454 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPFP49454 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPFP49454 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPFP49454 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CENPFP49454 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms