Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOP2P46087 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOP2P46087 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NOP2P46087 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NOP2P46087 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NOP2P46087 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NOP2P46087 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NOP2P46087 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NOP2P46087 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NOP2P46087 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP2P46087 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NOP2P46087 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms