Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FLT4P35916 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FLT4P35916 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FLT4P35916 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FLT4P35916 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FLT4P35916 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FLT4P35916 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FLT4P35916 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms