Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT9P35527 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT9P35527 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT9P35527 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT9P35527 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT9P35527 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT9P35527 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT9P35527 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT9P35527 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT9P35527 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT9P35527 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT9P35527 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT9P35527 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms