Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PLNP26678 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PLNP26678 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PLNP26678 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PLNP26678 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms