Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP1P23763 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms