Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XPAP23025 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XPAP23025 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XPAP23025 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XPAP23025 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XPAP23025 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms