Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELK1P19419 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELK1P19419 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELK1P19419 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELK1P19419 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELK1P19419 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELK1P19419 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELK1P19419 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELK1P19419 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELK1P19419 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELK1P19419 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELK1P19419 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms