Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYN1P17600 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYN1P17600 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYN1P17600 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYN1P17600 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms