Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM1P13164 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM1P13164 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms