Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SELENOFO60613 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SELENOFO60613 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SELENOFO60613 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SELENOFO60613 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SELENOFO60613 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SELENOFO60613 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms