Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6DO43924 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms