Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TREHO43280 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREHO43280 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREHO43280 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREHO43280 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREHO43280 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREHO43280 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREHO43280 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREHO43280 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TREHO43280 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TREHO43280 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TREHO43280 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TREHO43280 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TREHO43280 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TREHO43280 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms