Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms