Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6L9A6NEM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms