Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIMS3Q9UJD0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms