Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCF2Q9UG63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCF2Q9UG63 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms