Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PGPEP1Q9NXJ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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