Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT1Q9NXH9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms