Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHBDL2Q9NX52 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHBDL2Q9NX52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms