Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms