Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LHX9Q9NQ69 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms