Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CWC22Q9HCG8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CWC22Q9HCG8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms